背景
染色质免疫沉淀 (ChIP) 是一种分子生物学技术，用于研究蛋白质-DNA相互作用并识别基因组中特定蛋白质的结合位点。通过 ChIP，研究人员可以了解转录因子如何与基因启动子区域结合，组蛋白修饰如何影响染色质的可及性和基因表达，以及非编码RNA如何与染色质相互作用。随着技术的发展，衍生技术不断涌现，提供了更高通量和更精准的分析方法。
染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）是一种用于研究蛋白质-DNA相互作用的高通量测序技术，它将ChIP技术与新一代测序（NGS）技术相结合。在生理状态下，通过超声波或酶处理裂解细胞、分离染色体、随机切割染色质，使细胞内的DNA与蛋白质发生交联。然后利用抗原抗体特异性识别反应，沉淀出与目标蛋白结合的DNA片段。之后，通过回交联释放结合蛋白的DNA片段，纯化目标DNA片段并构建文库。最后通过高通量测序获得蛋白质-DNA相互作用的信息。
ChIP-seq 分析工作流程
ChIP 技术广泛应用于分子生物学和表观遗传学研究，使科学家能够探索蛋白质和 DNA 之间的相互作用。
转录因子分析
通过使用针对特定转录因子的抗体，ChIP 可以揭示这些转录因子在基因组中的精确结合位点，从而了解它们如何调控基因表达。这些转录因子参与调控导致癌症、自身免疫性疾病、过敏和许多其他疾病的表观遗传紊乱。
表观遗传修饰分析
ChIP技术可以分析组蛋白的各种翻译后修饰，如乙酰化、甲基化等，这些修饰与染色质状态和基因表达调控密切相关。
染色质结构和状态的分析
特定组蛋白残基的乙酰化或甲基化可影响基因激活或沉默以及高阶染色质结构。通过 ChIP，这些组蛋白修饰特征可用于预测特定基因组区域的表观遗传调控特性。
疾病相关机制的研究
ChIP技术在疾病机制研究中也发挥着重要作用，它可以揭示疾病状态下基因调控网络的变化，还可以通过影响特定蛋白质与DNA的相互作用来研究药物的疗效。
服务流程
分析流程
获取测序数据（Raw Data）后，首先需要进行数据筛选，得到高质量数据（Clean Data）。并将Clean Data与参考基因组比对，得到BAM文件。然后进行全基因组Peak扫描，并通过GO分析、KEGG通路分析、motif分析、可视化等手段分析差异基因。
优势
- 一站式服务
- 专业生物信息学分析
- 高分辨率和高信噪比结果
- 市场最优价格
