抗原-抗体分子对接

抗体是免疫系统必不可少的识别元件，它与各种抗原紧密特异性结合，从而阻断其活性或将其标记并破坏。抗体越来越多地被用作诊断工具和治疗药物，而抗体设计/工程化过程中的一个重要环节是获得高质量的抗体-抗原复合物的三维结构。X射线晶体学提供了关于蛋白质结构和相互作用的最准确、最详细的数据，然而，抗体-抗原复合物的共结晶仍然是一项重大挑战，目前已确定的抗体与其抗原复合物的结构数量仍然相对较少。

相比之下，计算机建模提供了一种快速且经济的方法来生成此类复合物的结构模型。重链和轻链的可变结构域 (Fvs) 在计算机建模中尤为重要，因为它们通常赋予抗体对其抗原靶标的大部分或全部特异性。我们的建模方案考虑了抗体-抗原相互作用的最新科学知识以及 CDR 区域（尤其是 H3 环）的构象灵活性，并利用最先进的对接软件工具来寻找在能量上有利的复合物形成过程中抗体和抗原的相对变换和构象。一般步骤如下：首先，进行刚体全局搜索，生成几何上合理的抗体-抗原复合物模型。在此过程中，可以应用用户定义的约束（从实验数据中获得）来限制搜索空间。使用专门为抗体系统开发的评分函数对生成的模型进行评分和排序。然后对得分最高的结构进行聚类，并从中选取最大的聚类代表，通过能量最小化进行结构优化，最后提交给客户。

抗体-抗原对接过程

迈博睿生物采用计算对接技术，搜索抗体（Fv、Fab 或全抗体）与其抗原之间平移和旋转空间中所有可能的结合模式，并模拟复合物形成过程中可变环的构象变化。这是理解大分子相互作用背后的物理化学作用力的重要手段，并且可以根据对接复合物构建工作假设，指导进一步的实验，从而合理设计基于抗体的疗法。

我们提供定制化服务，以满足客户的特定研究目标。如需了解更多关于抗体-抗原对接服务的详细信息，请随时联系我们。