下方列出了抗体相关的氨基酸测序工具、核苷酸测序工具、结构建模工具以及杂交瘤/细胞培养数据库。此外，还包括单克隆抗体和多克隆抗体的专业研究数据库。
1.ABG：抗体三维结构目录 - 该目录由抗体组 (ABG) 创建，可快速访问蛋白质数据库 (PDB) 中收录的抗体结构。目录中，每个 PDB 条目都包含指向原始来源的超链接，方便用户获取完整信息。VH 和 VL 序列已进行比对，并在 VH 和 VL 比对部分中列出。该目录每月更新。
2.ABG：小鼠种系基因目录- 小鼠 VH 和 VK 种系片段目录，墨西哥国立自治大学 (UNAM) 生物技术研究所 抗体小组网页的一部分
3.AbMiner—— 用户可以搜索市售抗体，并将其与相应的基因组标识符进行匹配。该数据库的一个独特之处在于，它仅收录经Western blot筛选的抗体，这使得所列抗体更便于科研使用。
3.Abnum 是一款在线工具，可让您使用 Kabat 或 Clothia 方案自动对抗体序列或结构进行编号，以及使用作者创建的新改进的 Clothia 方案。
4.Antibody Central 是一个抗体检索门户网站，它将目录抗体和研究出版物与 UniProt 蛋白质信息资源连接起来。该工具采用专有的抗体名称词典模型——一个包含蛋白质名称、同义词和被识别为抗体名称的符号的集合，这些名称和符号均通过对 HighWire Press 中科学出版物的全文检索进行验证。
5.将bNAber.org（HIV-1 广谱中和抗体数据库）添加到“抗体相关数据库和软件”列表中
6.欧洲细胞培养物保藏中心 ——为科研界提供细胞培养物保藏服务，拥有超过40000种细胞系，其中包括450多种抗体。
7.HIV 分子免疫学数据库 - 列出了 HIV 特异性单克隆抗体、HIV 蛋白结合位点图谱、显示线性结合域全局变异的序列比对、简要描述了单克隆抗体在 HIV 研究中的应用（附 Medline 链接），以及数据库中许多抗体的获取途径。
8.杂交瘤数据库 （HDB）保存着关于杂交瘤及其免疫反应产物各个方面的数据。数据包括杂交瘤的构建信息、其分泌产物的反应性和非反应性。此外，HDB还包含特定杂交瘤及其单克隆抗体（Mab）产品的可用性信息。HDB中的信息来源于文献、产品目录和调查表。
9.IMGT®，即国际免疫遗传信息系统® ，由Marie-Paule Lefranc（法国蒙彼利埃第二大学，法国国家科学研究中心）于1989年创建。IMGT是一个综合性的知识资源，专门研究人类和其他脊椎动物的免疫球蛋白、T细胞受体、主要组织相容性复合体、免疫球蛋白超家族、主要组织相容性复合体超家族以及相关的免疫系统蛋白。IMGT包含序列数据库（IMGT/LIGM-DB，一个包含人类和其他脊椎动物免疫球蛋白和T细胞受体的综合数据库，并提供完整注释序列的翻译；IMGT/MHC-DB；IMGT/PRIMER-DB）、基因组数据库（IMGT/GENE-DB）、结构数据库（IMGT/3Dstructure-DB）、网络资源（IMGT Repertoire）以及交互式工具（IMGT/V-QUEST；IMGT/JunctionAnalysis等）。 IMGT 主页提供了一个访问所有免疫遗传学数据的统一入口。
10.Kabat数据库——搜索Kabat数据库中与免疫学相关的蛋白质序列。本网站会定期更新。
11.Kabatman—— 分子生物学家和晶体学家研究抗体结构的重要信息来源。该网站还包含KabatMan数据库，可用于搜索Kabat序列数据库以查找序列特征；AbCheck，可用于将您的抗体序列与Kabat序列数据库进行比对，以查找异常特征；以及Chothia，可用于查找抗体序列中互补决定区（CDR）的典型序列分配。
12.Macromoltek——简化分子模拟。抗体建模、侧链堆积、重编号以及其他基于网络的抗体开发计算工具，均可在易于使用的工作空间中轻松获取。Macromoltek 还为需要更专业分析的客户提供咨询服务。立即免费试用，体验我们的各项功能！
13.单克隆抗体索引 ——一个生物技术数据库，每年更新超过9000种单克隆抗体的信息，这些抗体用于癌症、移植、感染、心脏相关疾病等的诊断和治疗……
14.PIGS （免疫球蛋白结构预测） ——使用此网页界面，基于规范结构方法自动构建免疫球蛋白可变区模型。输出结果为目标抗体的三维模型，可下载或在线显示。
15.PipeBio是一个集成的生物信息学平台，用于抗体序列分析和工程改造。它提供先进的图形化交互式筛选功能和强大的计算引擎，专为处理当今药物研发流程中常见的大量 NGS 和 Sanger 测序数据集而设计。该软件支持注释、聚类、筛选、生物淘选、克隆等多种功能。
16.RosettaAntibody - FV 同源建模服务器 - 同源建模服务器，利用基于知识的技术进行模板选择、从头环建模以创建 CDR-H3、嫁接非 H3 CDR 环以及对接以优化轻链和重链的方向，从而预测抗体 Fv 区结构。
17.SACS（抗体晶体结构概要）是一个自动更新的蛋白质数据库 （PDB）中所有抗体结构的概要信息库。新收到的PDB文件会立即进行处理，以确定其是否为抗体；如果是，则会提取相关信息并发布到网络上。
18.Scaligner - Scaligner 是一个用于分析抗体序列的平台：CDR 识别、使用 Kabat 和 IMGT 方案进行氨基酸编号、多序列比对以及存储在安全存储库中。
19.SCOP - 通过关键词或序列搜索“SCOP”（蛋白质结构分类）以查找有关抗体的参考文献和结构信息。
20.STATdxPathIQ （原名 ImmunoQuery）是一款病理诊断决策工具，它利用最新的同行评审文献，为鉴别外观相似的肿瘤类型提供免疫组化组合建议。该网站还包含高质量的典型和非典型组织化学及免疫组化图像，以帮助研究人员进行鉴别诊断。STATdxPathIQ 由 ImmunoQuery 发展而来，ImmunoQuery 是一款供病理学家使用的荟萃分析搜索引擎。
21.V BASE - V BASE 是一个综合性的人类种系可变区序列目录，收录了超过一千条已发表的序列，包括 Genbank 和 EMBL 数据库中当前版本的序列。
22.WAM（Web Antibody Modelling ，网络抗体建模 ）是一个在线工具，可根据抗体Fv序列生成其三维模型。WAM基于Oxford Molecular公司的AbM平台，利用序列同源性构建框架结构，选择序列同源性最高的经典抗体构建经典环，并结合数据库搜索和构象搜索构建非经典环。随后，系统会采用能量学和知识库方法对生成的模型进行筛选。学术用户首次建模免费；后续建模需支付少量费用（100美元）。商业用户可访问网站了解更多详情。
